“/”根目錄部分有以下子目錄：
/usr 目錄包含所有的命令、程序庫、文檔和其它文件。這些文件在正常操作中不會被改變的。這個目錄也包含你的Linux發行版本的主要的應用程序，譬如，Netscape。
/var 目錄包含在正常操作中被改變的文件：假脫機文件、記錄文件、加鎖文件、臨時文件和頁格式化文件等。
/home 目錄包含用戶的文件：參數設置文件、個性化文件、文檔、數據、EMAIL、緩存數據等。這個目錄在系統省級時應該保留。
/proc 目錄整個包含虛幻的文件。它們實際上並不存在磁盤上，也不占用任何空間。（用ls –l 可以顯示它們的大小）當查看這些文件時，實際上是在訪問存在內存中的信息，這些信息用於訪問系統
/bin 系統啟動時需要的執行文件（二進制），這些文件可以被普通用戶使用。
/sbin 系統執行文件（二進制），這些文件不打算被普通用戶使用。（普通用戶仍然可以使用它們，但要指定目錄。）
/etc 操作系統的配置文件目錄。
/root 系統管理員（也叫超級用戶或根用戶）的Home目錄。
/dev 設備文件目錄。LINUX下設備被當成文件，這樣一來硬件被抽象化，便於讀寫、網絡共享以及需要臨時裝載到文件系統中。正常情況下，設備會有一個獨立的子目 錄。這些設備的內容會出現在獨立的子目錄下。LINUX沒有所謂的驅動符。
/lib 根文件系統目錄下程序和核心模塊的共享庫。
/boot 用於自舉加載程序（LILO或GRUB）的文件。當計算機啟動時（如果有多個操作系統，有可能允許你選擇啟動哪一個操作系統），這些文件首先被裝載。這個目錄也會包含LINUX核（壓縮文件vmlinuz），但LINUX核也可以存在別處，只要配置LILO並且LILO知道LINUX核在哪兒。
/opt 可選的應用程序，譬如，REDHAT 5.2下的KDE （REDHAT 6.0下，KDE放在其它的XWINDOWS應用程序中，主執行程序在/usr/bin目錄下）
/tmp 臨時文件。該目錄會被自動清理干淨。
/lost+found 在文件系統修復時恢復的文件
“/usr”目錄下比較重要的部分有：
/usr/X11R6 X-WINDOWS系統（version 11, release 6)
/usr/X11 同/usr/X11R6 （/usr/X11R6的符號連接）
/usr/X11R6/bin 大量的小X-WINDOWS應用程序（也可能是一些在其它子目錄下大執行文件的符號連接）。
/usr/doc LINUX的文檔資料（在更新的系統中，這個目錄移到/usr/share/doc）。
/usr/share 獨立與你計算機結構的數據，譬如，字典中的詞。
/usr/bin和/usr/sbin 類似與“/”根目錄下對應的目錄（/bin和/sbin），但不用於基本的啟動（譬如，在緊急維護中）。大多數命令在這個目錄下。
/usr/local 本地管理員安裝的應用程序（也可能每個應用程序有單獨的子目錄）。在“main”安裝後，這個目錄可能是空的。這個目錄下的內容在重安裝或升級操作系統後應該存在。
/usr/local/bin 可能是用戶安裝的小的應用程序，和一些在/usr/local目錄下大應用程序的符號連接。
/proc目錄的內容：
/proc/cpuinfo 關於處理器的信息，如類型、廠家、型號和性能等。
/proc/devices 當前運行內核所配置的所有設備清單。
/proc/dma 當前正在使用的DMA通道。/proc/filesystems 當前運行內核所配置的文件系統。
/proc/interrupts 正在使用的中斷，和曾經有多少個中斷。
/proc/ioports 當前正在使用的I/O端口。
舉例，使用下面的命令能讀出系統的CPU信息。
cat /proc/cpuinfo
/bin
bin是binary的縮寫。這個目錄沿襲了UNIX系統的結構，存放著使用者最經常使用的命令。例如cp、ls、cat，等等。
/boot
這裡存放的是啟動Linux時使用的一些核心文件。
/dev
dev是device（設備）的縮寫。這個目錄下是所有Linux的外部設備，其功能類似DOS下的.sys和Win下的.vxd。在Linux中設備和文件是用同種方法訪問的。例如：/dev/hda代表第一個物理IDE硬盤。
/etc
這個目錄用來存放系統管理所需要的配置文件和子目錄。
/home
用戶的主目錄，比如說有個用戶叫wang，那他的主目錄就是/home/wang也可以用~wang表示。
/lib
這個目錄裡存放著系統最基本的動態鏈接共享庫，其作用類似於Windows裡的.dll文件。幾乎所有的應用程序都須要用到這些共享庫。
/lost+found
這個目錄平時是空的，當系統不正常關機後，這裡就成了一些無家可歸的文件的避難所。對了，有點類似於DOS下的.chk文件。
/mnt
這個目錄是空的，系統提供這個目錄是讓用戶臨時掛載別的文件系統。
/proc
這個目錄是一個虛擬的目錄，它是系統內存的映射，我們可以通過直接訪問這個目錄來獲取系統信息。也就是說，這個目錄的內容不在硬盤上而是在內存裡。
/root
系統管理員（也叫超級用戶）的主目錄。作為系統的擁有者，總要有些特權啊！比如單獨擁有一個目錄。
/sbin
s就是Super User的意思，也就是說這裡存放的是系統管理員使用的管理程序。
/tmp
這個目錄不用說，一定是用來存放一些臨時文件的地方了。
/usr
這是最龐大的目錄，我們要用到的應用程序和文件幾乎都存放在這個目錄下。其中包含以下子目錄；
/usr/X11R6
存放X-Window的目錄；
/usr/bin
存放著許多應用程序；
/usr/sbin
給超級用戶使用的一些管理程序就放在這裡；
/usr/doc
這是Linux文檔的大本營；
/usr/include
Linux下開發和編譯應用程序需要的頭文件，在這裡查找；
/usr/lib
存放一些常用的動態鏈接共享庫和靜態檔案庫；
/usr/local
這是提供給一般用戶的/usr目錄，在這裡安裝軟件最適合；
/usr/man
man在Linux中是幫助的同義詞，這裡就是幫助文檔的存放目錄；
/usr/src
Linux開放的源代碼就存在這個目錄，愛好者們別放過哦！
/var
這個目錄中存放著那些不斷在擴充著的東西，為了保持/usr的相對穩定，那些經常被修改的目錄可以放在這個目錄下，實際上許多系統管理員都是這樣干的。順帶說一下系統的日志文件就在/var/log目錄中。
總結來說：
· 用戶應該將文件存在/home/user_login_name目錄下(及其子目錄下)。
· 本地管理員大多數情況下將額外的軟件安裝在/usr/local目錄下並符號連接在/usr/local/bin下的主執行程序。
· 系統的所有設置在/etc目錄下。
· 不要修改根目錄（“/”）或/usr目錄下的任何內容，除非真的清楚要做什麼。這些目錄最好和LINUX發布時保持一致。
· 大多數工具和應用程序安裝在目錄：/bin, /usr/sbin, /sbin, /usr/x11/bin,/usr/local/bin。
· 所有的文件在單一的目錄樹下。沒有所謂的“驅動符”。