眾所周知的事實是，Linux經過了10多年的發展，其在桌面端的應用始終未能形成氣候，所以在提到Linux應用的時候，某些擁戴Linux的人士總會用Linux在服務器端的應用來證明Linux比Windows的強大和具有的發展前景。那麼事實果真是這樣嗎？
筆者認為，之所以業內認為Linux在服務器端的應用好於Windows，首先提及的是Linux的穩定性。這也難怪，服務器一般都是企業級的應用，所以系統的安全性無論是對於企業應用的系統還是企業的業務來說都至關重要。但有一點人們忽視了，那就是企業級的應用一般跑的程序都相對的單一。例如有的企業服務器專門來跑ERP，有的只跑數據庫，這是Linux的特點所決定的。與之相反，基於Windows的服務器往往通過虛擬化會跑多個應用，既然是跑多個應用，與只跑單一應用的Linux相比，其出現的問題的幾率就相對要大一些。對此，相關的業內專家在接受筆者采訪時稱，所謂的Linux的穩定性只是相對的，應用相對單一和簡單，所以穩定性相對就要高些，這從另一個層面印證了筆者的有關Linux在服務器領域應用中與Windows相比只是相對穩定的結論，同時說明Linux系統的問題在於其許多功能尚未被廣泛使用，比如客戶操作系統環境的虛擬化，Linux系統在這一領域的配置是全新的，而Windows系統則可將當前服務器整合為虛擬服務器。
其二就是人們通常認為，Linux的安全性比Windows要高，受到外部攻擊要少，所以對於企業級的服務器應用，Linux比Windows更具適用性。其實這裡面依舊存在著一些誤區。據反病毒軟件廠商賽門鐵克公司一份有關軟件安全的報告顯示，在所有的商業性操作系統中，Windows操作系統中出現的漏洞數量最少，而且發布補丁軟件的速度最快。而在美國的一家IT安全公司Security Innovation有關Linux和Windows安全性的報告中稱，微軟Windows Server 2003的安全性要高於Red Hat Linux.該報告是將Windows Server 2003與Red Hat Linux的服務器版Enterprise Server 3進行了對比性研究，將兩個版本的基礎配置、運行數據庫及web服務器的進行對比後得出的結論，即微軟的這款服務器操作系統的安全性高於Red Hat Linux.其實這也從另一個角度說明Linux在服務器領域的應用並不像有的業內人士稱的占有絕對的優勢（據稱占服務器市場的30%左右），這從Windows受到的外部攻擊要遠遠多於Linux可見一斑。
第三就是業內認為Linux在企業級服務器的部署成本要低於微軟的Windows.眾所周知，企業級服務器系統的所有成本包括硬件、軟件和支持費用。誠然，Linux軟件的部署成本相對於Windows較為低廉，但對於企業來說，部署之後的服務至關重要，甚至要超出部署系統本身。但在服務方面，顯然Linux要高於Windows.IDC在統計了北美104家公司對各自Linux和Windows服務器系統總開支後得出結論稱，運行Linux服務器軟件管理計算機網絡所需要的維護和修理費用遠遠超過免費獲得軟件所得到的實惠，最終導致成本升高。該報告同時稱，支持一個100個全天候用戶的網絡服務器5年所需費用為，Linux系統13263美元，Windows2000系統11787美元。對於文件管理，打印，和安全服務器，兩者的成本比較與此類似。由此可見，Linux初期采購成本的低廉掩蓋了其後續的支持服務的費用，所以說，所謂的Linux在服務器應用中較微軟的Windows成本更低也相對的。
第四則是有人以Linux在企業級服務器中應用的增長速度來說明其比Windows更有發展前途。不錯，Linux曾經給業內一種增長很快的感覺，尤其是在服務器領域。但那已經是過去幾年的事情了。去年，全球知名的金融公司UBS發布了一項每季度針對CIO的印象調查結果，其中顯示的數字對Linux不利。這份名為“CIO脈搏：IT趨勢每季度印象調查”的報告說，Linux在服務器端的使用增長顯著放慢。根據這份據稱調查了“超過60名CIO”的報告，在目前尚未使用Linux的受調查者中，有90%在2007年不會采用這一操作系統。 這一數字比之前UBS對相同問題的調查結果提高了3%，與2006年時60%的數字相比更是顯著增加。這完全印證了Linux使用增長在放緩的趨勢。
此外，更對Linux不利的是，由於被Windows Server的應用軟件、性能及價格所吸引，許多Linux 的大型企業用戶開始逐漸轉向此操作系統。在由GfK Custom Research North America主辦的網上調查—2007年微軟高性能計算資本市場調查中，微軟在該領域的潛力被突出。154個高性能處理產品資本市場的企業用戶反饋顯示，大約83%考慮在下一個工程中采用微軟的解決方案，24%計劃在下一年或一半年裡將企業高性能處理環境增加1000個網點或者更多。而Sun微系統公司的用戶也在從Solaris系統向微軟Windows系統遷移。
綜上所述，筆者認為，所謂的Linux在企業級的服務器應用要強於Windows並不客觀和全面，而種種的事實表明，Windows在企業級的服務器應用仍舊具有優勢，尤其隨著微軟最新的Windows Server 2008的推出，Windows在服務器市場的應用會更加強勁
