你或許可以免費下載並安裝Linux，而Linux或許又能為你提供商業軟件所不具備的自由度，但千萬別就此以為所有關於Linux的東西都是免費的。你或許是節省下了大筆的資金，但你卻可能付出了一些隱蔽成本而不自知。
第一項隱蔽成本是不確定性。 雖然很難明確定義什麼才是不確定性，但這並不代表可以就此忽略這個問題。 當你遵循正確的系統要求去安裝Windows XP、 Vista或Mac OS X時，除非你配置錯誤或者組件損壞，否則所有你想安裝的東西都能順利安裝上去(比如wifi配適器、網卡、顯卡等)，並工作正常。
在購買硬件方面也是如此。 某些硬件只能工作於特定的平台之上，如果你打算購買硬件，那麼你必須了解系統要求，以保證這些硬件可以正常使用。 雖然這種情況並非每每都正確，但是出錯的幾率微乎其微。
但涉及到Linux，事情就不是那麼簡單了。 首先，Linux在市場上所占的份額很小(約0.7%)。 由於市場占有率太小，因此它很難吸引軟件和硬件廠商去積極投入。 盡管Linux社區覺得0.7%的用戶群已經相當龐大，而且也有一些公司開始宣稱對Linux提供支持，但由於市場占有率過低的原因，就算是世界上最頂尖的廠商，真正投入到Linux中的精力也不會太高。 而且它的盈利邊際並不豐厚，因此廠商也提不起興趣來對各種版本的Linux提供支持。
另一項隱藏成本就是時間。 盡管近幾年來Linux在安裝的速度和方便性上有所提高，但是這個流程依然有待完善。 部分老生常談的問題依然存在(比如wifi配適器)。如果你無意中運行了tar的壓縮命令，那你就不得不面對長時間的等待。 諸如此類的問題還有很多，比如Vista和Leopard可以直接播放DVD，而Linux用戶卻依然被Codecs的問題搞得暈頭轉向。 當然，你可以購買播放軟件，其中有些效果的確不錯，但是這樣一來免費OS的優勢就將不再。
此外，支持問題也相當耗時，你需要將你的疑問貼到論壇裡，然後等待別人作出解答。 通常都會有經驗豐富的人對你的提問做出妥善的解答。但如果你所描述的問題晦澀難明，或非常少見棘手，那麼你可能要等上很長一段時間才有下文。
另一個會耗費掉你大量時間的問題就是版本選擇。 Linux社區中有許多人均表示如此多樣的Linux版本實際上會妨礙向Linux過渡。 當然，有選擇也不是壞事。 比如Ubuntu的快速成長使它成為了主流版本，而gOS在低價PC市場上也取得了成功。 但是對用戶來說，從這麼多的版本中選擇出一款合適的的確非常耗時，尤其是當他們在兩個版本之間舉棋不定時。 太多的選擇有時也是一種負擔。
以上這些問題並不代表人們就要把Linux拒之門外，而是這些問題在選擇Linux版本時應當多加關注。 雖然“免費”二字有很大的吸引力，但重要的是牢記除了下載免費操作系統之外，若想讓系統正常運作起來，你還有許多方面需要考慮