修改用pdfedit，加注記用xournal，合並用pdktk.
當用戶在尋找適宜的PDF編輯器時，Linux PDF編輯軟件吸引了大家的眼球。它是一個自由，開源的PDF文檔處理器，而且在圖形用戶界面以及命令行界面都可以使用。
Linux PDF editor是一個可運行腳本的軟件，幾乎所有的腳本都可以運行。對於用戶來說，PDFedit是一個入門很快的軟件，它可以實現：書寫/創建/編輯PDF文件；打印、保存PDF文檔；還可以把PDF文件轉化成XML等等。
用戶可以在Debian或者是Ubuntu Linux上，輸入 $ sudo apt-get install pdfedit ，即可安裝PDFedit.
運行PDFedit，只需輸入：
$pdfedit /path/to/pdf.file &
$ pdfedit &
如果你只需要對pdf加注記的話，xournal 是一個不錯的選擇。
另外在開源界還有一些其它的PDF文檔編輯軟件，比如說：
Scribus：即開源桌面出版系統程序軟件。它運行在裝有Linux，Mac以及Windows的PC中。這個軟件還可以很好的用於PDFEdit. 安裝時，用戶只需輸入： $ sudo apt-get install scribus 就可以了。
使用Scribus編輯PDF文檔的操作順序是：啟用Scribus>打開新的文件>插入>鏡像>雙擊>選擇PDF文件
還有Flpsed，也是一個可編輯PDF文檔的軟件，用戶可以輸入 $ sudo apt-get install flpsed 來安裝該軟件；輸入 $ flpsed /path/to/pdf-file.pdf &就可以編輯文件了。
另外還有一個Gimp，不過用戶需要有一些Gimp編輯PDF文檔的基本常識。Gimp幾乎可以在所有的Linux 分布版系統上運行，不過，這個最好不要作為首選的PDF編輯器。
用戶不僅可以使用這些軟件編輯PDF文檔，還可以通過Web浏覽器，完成在線處理。
對於類似於Linux或者是Unix操作系統的用戶來說，PDFEdit是最好的開源編輯軟件。不過該軟件對於PDF文檔的加密保護暫時還是不支持。