首先要明確ubuntu中安裝軟件的幾種方式： 1、APT方式
（1）普通安裝：apt-get install softname1 softname2 …;
（2）修復安裝：apt-get -f install softname1 softname2… ;(-f Atempt to correct broken dependencies)
（3）重新安裝：apt-get –reinstall install softname1 softname2…;
2、Dpkg方式
（1）普通安裝：dpkg -i package_name.deb
該種方式需要下載軟件到本地，並且cd到該軟件所在的目錄才能正確執行上述命令
3、源碼安裝（.tar、tar.gz、tar.bz2、tar.Z）
首先解壓縮源碼壓縮包然後通過tar命令來完成
a．解xx.tar.gz：tar zxf xx.tar.gz
b．解xx.tar.Z：tar zxf xx.tar.Z
c．解xx.tgz：tar zxf xx.tgz
d．解xx.bz2：bunzip2 xx.bz2
e．解xx.tar：tar xf xx.tar
然後進入到解壓出的目錄中，建議先讀一下README之類的說明文件，因為此時不同源代碼包或者預編譯包可能存在差異，然後建議使用ls -F –color或者ls -F命令（實際上我的只需要 l 命令即可）查看一下可執行文件，可執行文件會以*號的尾部標志。
一般依次執行./configure
make
sudo make install
即可完成安裝。
其次，知道典型的幾種軟件包的卸載方式 1、APT方式
（1）移除式卸載：apt-get remove softname1 softname2 …;（移除軟件包，當包尾部有+時，意為安裝）
（2）清除式卸載 ：apt-get –purge remove softname1 softname2…;(同時清除配置)
清除式卸載：apt-get purge sofname1 softname2…;(同上，也清除配置文件)
2、Dpkg方式
（1）移除式卸載：dpkg -r pkg1 pkg2 …;
（2）清除式卸載：dpkg -P pkg1 pkg2…;
APT常用命令參數 apt-cache search package 搜索軟件包
apt-cache show package 獲取包的相關信息，如說明、大小、版本等
sudo apt-get install package 安裝包
sudo apt-get install package –reinstall 重新安裝包
sudo apt-get -f install 修復安裝
sudo apt-get remove package 刪除包
sudo apt-get remove package –purge 刪除包，包括配置文件等
sudo apt-get update 更新源
sudo apt-get upgrade 更新已安裝的包
sudo apt-get dist-upgrade 升級系統
apt-cache depends package 了解使用該包依賴那些包
apt-cache rdepends package 查看該包被哪些包依賴
sudo apt-get build-dep package 安裝相關的編譯環境
apt-get source package 下載該包的源代碼
sudo apt-get clean && sudo apt-get autoclean 清理無用的包
sudo apt-get check 檢查是否有損壞的依賴
使用APT方法安裝R及Rstudio 安裝R
sudo apt-get install R-base
安裝rstudio
1. sudo apt-get install gdebi-core（如果沒有問題，跳4）
2. 如果提示少了什麼東西，運行下面的命令
sudo apt-get -f install
3. 重新安裝gebedi
sudo apt-get install gdebi-core
4. sudo apt-get install libapparmor1
5. sudo gdebi rstudio-0.99.489-amd64.deb
6. 終端輸入rstudio，大功告成！