Unix系統在Unix的歷史發展中具有相當大的影響力，被很多商業廠家采用，成為很多商用Unix系統的基礎。而AT&T與其同時存在的Unix版本的影響就小得多。同時很多研究項目也是以BSD Unix為研究系統，例如美國國防部的項目─ARPANET，ARPANET今天發展成為了Internet，而BSD Unix中最先實現了TCP/IP，使Internet和Unix緊密結合在一起。
而AT&T的Unix系統實驗室，同時也在不斷改進他們的商用Unix版本，直到他們吸收了BSD Unix中已有的各種先進特性，並結合其本身的特點，推出了Unix System V版本之後，情況才有了改變。從此以後，BSD Unix和Unix SystemV形成了當今Unix的兩大主流，現代的Unix版本大部分都是這兩個版本的衍生產品。
Unix系統的版本號表示方式比較復雜，各種不同的Unix版本有自己的版本標識方式，如最早AT&T開發的內部Unix使用簡單的順序號來標識版本，從V 1到V 7。BSD使用主版本加次版本的方法標識，如4.2BSD，4.3BSD，在原始版本的基礎上還有派生版本，這些版本通常有自己的名字，如4.3BSD-Net/1，4.3BSD-Net/2。
AT&T使用羅馬數字來標識他們的對外發布的Unix版本，用Release來表示次版本。如System V Release 4（簡寫為SVR4）標識AT&T的Unix System V的第四次發布的版本。其他商業公司的Unix系統使用自己的版本標識，如Sun的Solaris 2.6，IBM的AIX 4.0等。 雖然AT&T的Unix System V也是非常優秀的Unix版本，但是BSD Unix在Unix領域內的影響更大。
AT&T的Unix系統實驗室一直關注著BSD的發展，在1992年，Unix系統實驗室指控BSDI── 一家發行商業BSD Unix的公司，違反了AT&T的許可權，發布自己的Unix版本，並進一步指控伯克利計算機系統研究組洩漏了Unix的商業機密（此時的4.3BSD中來自AT&T Un ix的代碼已經不足10%）。
這個官司影響了很多Unix系統廠商，使他們不得不從BSD Unix轉向Unix Sys tem V,以避免法律問題。以至於當今大多數商業Unix版本都是基於Unix System V的。
這件有關Unix系統版權的案子直到Unix系統實驗室被AT&T賣給了Novell公司後才得以解決， Novell不打算陷入這樣的法律紛爭中，因此就采用了比較友好的做法。伯克利的CSRG被允許自由發布BSD，但是其中來自於AT&T的代碼必須完全刪除。
因此CSRG就對他們最新的4.4BSD進行了修改，刪除了那些來自於AT&T的源代碼，發布了4.4 BSD Lite版本（該系統是不完整的，尤其對於英特爾386體系的計算機系統）。由於這個版本不存在法律問題，4.4BSD Lite成為了現代BSD Unix系統的基礎版本。