今日，最為人所知的Unix操作系統分支有：Linux、BSD系列與Solaris。其中Linux基本上可說最符合他一開始所設定的Freax目標（即386平台下的免費Unix操作系統）；而BSD延續了Unix操作系統的學術研發傳統，同時也是Macs作業系統的基礎。而Solaris則在Plan9模型上實作網路運算，帶領Unix操作系統進入下一代。
因為這些系統在來源與設計目標上的一致，要使用Unix操作系統，各平台絕大部分的所需知識都是相同的。從存取資料、開發程式庫到每日工作等等的核心程序，在所有主要的Unix操作系統分支版本上的工作方式都相同。
另外，數以百計的GNU工具程式與上千種的開放程式碼應用程式也是如此。從使用者與系統管理者的角度來看，不管使用什麼平台，Perl就是Perl，PostGres就是PostGress，SAMBA也不會因為主機使用Linux、NetBSD或Solaris平台，就有很大的不同。
的確，在某個已經過時的Unix操作系統分支上的實作經驗，無法直接套用在Linux、BSD或Solaris上面。然而，知道怎麼設定舊式系統，往往也會知道這些作法背後的運作方式與原理，這才是重點。而某個平台特定的操作方式，只要上網查查線上文件就可以了。
雖然這不代表一個通過Red Hat平台認證的人，馬上就能幫一台升陽多處理器電腦上的Oracle程式進行除錯，因為這兩個平台在細節與工具上都有所不同。但這表示了，相較於微軟系統認證人員，一個懂Red Hat的人在學習使用Solaris的過程中，遇到的困難會小得太多。
一般來說，認為Unix操作系統市場四分五裂的人，都試著把他跟微軟的Windows系統，做一個不適當的比較。簡而言之這是一種錯誤的比較方式：Windows是一個品牌，而Unix操作系統是一組概念。微軟的品牌一直被同一家公司所擁有，然而Windows 3.0、95、NT與Longhorn等系統不一定有一個連貫的概念。
反之，即使Unix操作系統的主機制造商一直努力試著要讓他們的產品與其他產品有所差異，所有這些產品卻仍舊被認為是同一個家族的產品。
有趣的是，覺得微軟的系統是持續不變，而Unix操作系統是多變的，這兩者都是市場上毫無根據的想法。
這種想法也迫使微軟要提供向下相容性──結果也造成了一個有趣的結果，就是今日六千萬台個人電腦，有時候必須要執行十年前的程式碼，卻不能讓這些寫給前一代系統的程式重新針對新的系統來進行編譯。