微軟在全美的市場佔有率幾已飽和，放眼天下，幾無人可與之競爭，目前僅有的威脅是漸成氣候的 Linux 作業系統。 同時，歐洲地區的電腦用戶一方面是基於民族自尊心，不願看到歐洲被美國公司的產品操控，因此不是那麼買微軟的帳，且有意捨微軟就 Linux 的作業系統。 因為在歐洲十分受歡迎的 Linux，願意將其內碼與資源公開給一般用戶使用，而 Linux 的優點是操作系統穩定，不易受病毒侵犯，相當受到商業用戶歡迎，包括法國、德國與中國大陸在內的國家都鼓勵企業與個人消費者使用Linux軟體。 以作業系統為主的 Linux，比起微軟雖只是小家，但因為其逐漸擴增的市場，愈來愈受歡迎，成為可能抵擋微軟巨獸的黑馬。 Linux 是一種公開電腦內碼的的作業系統，由來自全球義務的程式設計師撰寫程式及不時更新，免費提供用戶下載。微軟標榜的是以便宜的價格將軟體整套出售，但是 Linux 卻是免費使用。策略是用免費使用的手段，企圖拉下微軟的作業系統佔有率。 另外，Linux 的背後有很多公司在管理及支持其更新的程式設計，包括 Red Hat, SuSe, Ximian, Lindows 等公司，同時微軟最大的競爭對手 IBM 也擁抱Linux，向消費者大力推薦。 目前從華爾街至好萊塢的企業使用 Linux 的作業系統者佔多數，因為這些財務機構與製作動畫的公司使用大型電腦，需要的是電腦的穩定性以及避免病毒侵犯，目前 Linux 在伺服器市場的佔有率預估在15％ 至 20％，雖遠落後於微軟，但穩定成長。 目前雖在個人電腦的市場還有待努力，但各大支持 Linux 的公司也在增長中。兩年前，Linux 還名不見經傳，企業們也瞧不起 Linux 的威力，如今已不可同日而語。 另一方面，個人電腦價格勢必下降的現象也一直是微軟的壓力。因為大部分的個人電腦硬碟都在降價，但微軟卻仍沒有配合降價，例如Lindows 表示大力生產主機部份在 500 元的電腦，在大型量販店如Wal－Mart 的主機板每台售價 199 元。 設計 Linux 作業系統的核心人物 Linus Torvalds 表示，如果這些電腦配裝 Linux 的作業系統，整套電腦軟硬體的價格就可大幅下降，這也是微軟最大的挑戰。甚至有程式設計師預言，三年內微軟可能放棄他的作業系統，以保有其應用軟體的利潤。
