Linux CentOS下安裝MPICH以及運行第一個並行程序

一：Linux下安裝與配置MPICH

為了在Linux下運行我們的並行程序，我們需要安裝MPICH，現在的版本是MPICH2，下載地址：mpich2-1.5.tar.gz  [文件大小：21.77 MB] 下載： 

FTP地址：ftp://www.linuxidc.com

用戶名：www.linuxidc.com

密碼：www.muu.cc

在 2012年LinuxIDC.com\10月\Linux CentOS下安裝MPICH以及運行第一個並行程序

下載方法見 http://www.linuxidc.net/thread-1187-1-1.html

下載完成後，用SSH登錄Linux系統，在這裡我用的root的登錄身份。在/home 下創建一個目錄，用來表示某個用戶的文件 mkdir  houqingdong  ， 將tar.gz(注意，這裡是tar.gz後綴的壓縮文件，不一樣的壓縮文件在Linux下解壓縮時所用的命令也不一樣)，還要注意一點，就是解壓縮文件的過程一定要在Linux系統下完成，（起初的時候我是在Windows下解壓完成的，將解壓完成後的文件夾直接上傳到Linux下，在安裝執行./configure時會出現錯誤！！）。

現在我們解壓縮文件：tar -zxv -f mpich2-1.5.tar.gz(這裡是你自己的壓縮文件) ,然後會出現具體的解壓縮過程，解壓完畢後，在/home 下會出現mpich2-1.5這個文件夾

進入該文件夾：cd mpich2-1.5  ，進入之後，接下來我們要做的工作就是要配置它的安裝目錄，在這之前我們先在houqingdong文件夾下創建我們存放MPICH程序的文件夾，假如該文件夾為mpiexe :  cd /home/houqingdong    mkdir  mpiexe  ，創建完成後，就執行  ./configure -prefix=/home/houqingdong/mpiexe  就是配置我們的安裝目錄，這裡同樣會等待一段時間，等成功執行後，在mpich2-1.5下會生成mkfile文件，這裡我們執行的時候有時會出現這樣的提示：-bash: ./configure: Permission denied 這句話是提醒我們權限不夠，仔細看一下會發現configure沒有x(執行)權限，這裡我們要執行： chmod +x ./configure 即可，這句指令的意思是為configure增加x的權限

再一次執行：./configure -prefix=/home/houqingdong/mpiexe  同樣會等一段時間，最終執行完後不會報錯，才能繼續向下執行，如果發生某些錯誤，請參考：http://www.linuxidc.com/Linux/2008-12/17595.htm

上一步執行完我們接著執行： mkfile

執行完mkfile， 然後開始實際的安裝 執行  mkfile install，就會看到程序正在安裝，安裝完成後進入/home/houqingdong/mpiexe可以看到多出了很多像bin  include  lib樣的文件。

先在將我的第一個並行文件上傳到/home/houqingdong/目錄下：

程序為：

1. #include "mpi.h" 
2. #include <stdio.h> 
3.  
4. int main (int argc, char *argv[]) { 
5.    int i; 
6.    int id;               /* Process rank */ 
7.    int p;                /* Number of processes */ 
8.    void check_circuit (int, int); 
9.  
10.    MPI_Init (&argc, &argv); 
11.    MPI_Comm_rank (MPI_COMM_WORLD, &id); 
12.    MPI_Comm_size (MPI_COMM_WORLD, &p); 
13.  
14.    for (i = id; i < 65536; i += p) 
15.       check_circuit (id, i); 
16.  
17.    printf ("Process %d is done\n", id); 
18.    fflush (stdout); 
19.    MPI_Finalize(); 
20.    return 0; 
21. } 
22.  
23.  
24. /* Return 1 if 'i'th bit of 'n' is 1; 0 otherwise */ 
25. #define EXTRACT_BIT(n,i) ((n&(1<<i))?1:0) 
26.  
27. void check_circuit (int id, int z) { 
28.    int v[16];        /* Each element is a bit of z */ 
29.    int i; 
30.  
31.    for (i = 0; i < 16; i++) v[i] = EXTRACT_BIT(z,i); 
32.    if ((v[0] || v[1]) && (!v[1] || !v[3]) && (v[2] || v[3]) 
33.       && (!v[3] || !v[4]) && (v[4] || !v[5]) 
34.       && (v[5] || !v[6]) && (v[5] || v[6]) 
35.       && (v[6] || !v[15]) && (v[7] || !v[8]) 
36.       && (!v[7] || !v[13]) && (v[8] || v[9]) 
37.       && (v[8] || !v[9]) && (!v[9] || !v[10]) 
38.       && (v[9] || v[11]) && (v[10] || v[11]) 
39.       && (v[12] || v[13]) && (v[13] || !v[14]) 
40.       && (v[14] || v[15])) { 
41.       printf ("%d) %d%d%d%d%d%d%d%d%d%d%d%d%d%d%d%d\n", id, 
42.          v[0],v[1],v[2],v[3],v[4],v[5],v[6],v[7],v[8],v[9], 
43.          v[10],v[11],v[12],v[13],v[14],v[15]); 
44.       fflush (stdout); 
45.    } 
46. } 

如果我們現在想編譯文件： 在/home/houqingdong下執行：  mpicc -o hello  hello.c  這時候會提醒：-bash:mpicc  command not found 這是因為我們還沒有配置路徑

在命令行下輸入： export PATH=/home/houqingdong/mpiexe/bin:$PATH  注意：這裡僅僅是暫時的設置路徑，在重啟後效果會消失，如果想一勞永逸的配置，請google查詢

看一下我們配置是否成功可以執行一下  echo $PATH 看一下輸出結果中是否有我們的路徑

我們再來編譯一次： mpicc -o hello hello.c

然後在/home/houqingdong 目錄下會生成一個hello的可執行文件，然後運行 mpirun -n 2 ./hello 即可看到輸出結果，這裡我們采用2個處理器來執行。

輸出結果為：

嘿嘿 。。。 大功告成！！！！