舉例來說，根目錄下面有一個子目錄/bin，用於存放二進制程序。但是，/usr子目錄下面還有/usr/bin，以及/usr/local/bin，也用於存放二進制程序;某些系統甚至還有/opt/bin。它們有何區別?
長久以來，我也感到很費解，不明白為什麼這樣設計。像大多數人一樣，我只是根據《Unix文件系統結構標准》(Filesystem Hierarchy Standard)，死記硬背不同目錄的區別。
昨天，我讀到了Rob Landley的簡短解釋，這才恍然大悟，原來Unix目錄結構是歷史造成的。
話說1969年，Ken Thompson和Dennis Ritchie在小型機PDP-7上發明了Unix。1971年，他們將主機升級到了PDP-11。
當時，他們使用一種叫做RK05的儲存盤，一盤的容量大約是1.5MB。
沒過多久，操作系統(根目錄)變得越來越大，一塊盤已經裝不下了。於是，他們加上了第二盤RK05，並且規定第一塊盤專門放系統程序，第二塊盤專門放用戶自己的程序，因此掛載的目錄點取名為/usr。
也就是說，根目錄"/"掛載在第一塊盤，"/usr"目錄掛載在第二塊盤。除此之外，兩塊盤的目錄結構完全相同，第一塊盤的目錄(/bin, /sbin, /lib, /tmp...)都在/usr目錄下重新出現一次。
後來，第二塊盤也滿了，他們只好又加了第三盤RK05，掛載的目錄點取名為/home，並且規定/usr用於存放用戶的程序，/home用於存放用戶的數據。
從此，這種目錄結構就延續了下來。隨著硬盤容量越來越大，各個目錄的含義進一步得到明確。
/：存放系統程序，也就是At&t開發的Unix程序。
/usr：存放Unix系統商(比如IBM和HP)開發的程序。
/usr/local：存放用戶自己安裝的程序。
/opt：在某些系統，用於存放第三方廠商開發的程序，所以取名為option，意為"選裝"。