趙曉亮自2003年接替劉博擔任中科紅旗CEO以來，中科紅旗Linux產品在市場上的占有率節節攀升，並一度達到國內Linux市場50%份額的驕人業績，成為微軟Windows操作系統最大的競爭對手，而趙曉亮一躍成為IT界的重量級人物。
但是，自從2007年3月中科紅旗董事會決定“空降領導人”之後，趙曉亮和公司董事會之間的矛盾開始激化。趙曉亮的職務在3個月之內3次變動。董事會就是不給趙曉亮與其適配的職權，這直接導致了趙曉亮萌生去意。
實際上，今年5月20日中科紅旗代理董事會已經決議，代理總裁趙曉亮退居二線，總裁將另設他人。趙曉亮的職權已完全被架空。而所謂“空降領導人”之說，也因為賈棟接手CEO一職不了了之。賈棟歷任中科紅旗副總裁、渠道銷售部總經理、總裁助理等職，是典型的“紅旗人”。
不過讓趙曉亮或許惟一值得欣慰的是，中科紅旗的策略還將“趙規賈隨”。據中科紅旗內部人士透露，賈棟作為新任總裁兼CEO上任後，中科紅旗原有的市場、渠道等相關策略並不會有所改變。
另外，中科紅旗在趙曉亮時代也積累了一定的資本。從整個Linux界專做操作系統的行業來看，能夠得到全球IT廠商認證的只有3家公司，其在中國只有中科紅旗公司一家。
但是，由於近兩年來Novell、紅帽等國際廠商都在加速對中國Linux市場的蠶食，甲骨文等軟件巨頭虎視眈眈意欲插手，Linux產業內部競爭日趨激烈。而微軟Windows Vista的發布，更是對Linux產業雪上加霜，進一步擠壓了Linux的生存空間。趙曉亮時代的中科紅旗一去不返了。