在隨後的幾年裡，這家公司Linux預裝下滑到30萬套，而整個Linux產業也跌入低潮。2006是中國Linux發生“嬗變的一年”。中國Linux經過兩年的沉寂，產品不論在研發還是推廣上，都取得了巨大的進展。
2006年6月份開始，Linux廠商在OEM市場紛紛斬獲“大單”。6月，中標軟件與長城電腦簽約50萬大單，隨後又與浪潮簽約，在兩年內全部采用中標普華Linux；8月，共創開源簽約新藍集團，新藍電腦全部預裝共創開源軟件。
9月，簽約達到了頂點。中科紅旗簽約DELL，OEM訂單首次超過400萬套。戴爾宣布：在中國銷售的23款台式機、筆記本，將全面預裝紅旗Linux操作系統；在戴爾改旗易幟的同時，惠普和聯想也推出SuSE Linux筆記本。
據計世資訊調查：2006年二季度，中國Linux軟件銷售額達3100萬元，與去年同期相比增長23.7%。在行業市場，政府、金融、電信、教育，共占據74.3%的市場，分別占總體應用的24.0%、19.0%、16.2%、15.1%份額。
二季度中國Linux市場格局中，Redflag，Novell，Redhat位居市場前3名，市場份額依次為：28.7%，24.7%，21.8%。 在短短的幾年間，Linux服務器也取得了驕人的戰績。無論是低端數據中心，還是傳統高端Unix壟斷的電信應用，Linux都得到廣泛的應用和部署，甚至NASA和歐空局的宇航級場合，Linux也正在被逐步采用。
在Linux版圖變化的背後，是一場操作系統產業格局的變革。軟件“正版化運動”的推動、商業軟件對Linux的認同、Linux陣營對產業發展的分歧，以及Linux強勁的商業化沖動，多種因素促成Linux的“嬗變之旅”。
中國是微軟最後一塊“風水寶地”，在中國肥沃的黑土下面，埋藏大量的真金白銀。多少年來，微軟持續對華投資但收獲不大，盜版成為中國軟件發展的最大難題。
盜版軟件和惡性競爭，阻礙了中國軟件業的發展。更深層次的原因在於，中國粗放經營的經濟模式，大量從事來料加工和代工生產，各行業利潤率持續走低，個人和行業購買力低下，是中國軟件盜版猖獗的主要原因。
2006年中國同歐盟、美過貿易，再次爆發大規模的沖突。反傾銷、知識產權和匯率，成為雙方爭論的焦點。
4月10日，四部委下發《關於計算機預裝正版操作系統軟件有關問題的通知》，和《政府部門購置計算機辦公設備必須采購已預裝正版操作系統軟件產品的通知》，這是中國政府談判妥協的產物，中國開始了軟件“正版化運動”。
通知規定境內生產和銷售的電腦，都應當預裝正版操作系統軟件。微軟在中美貿易沖突中，不戰而屈人之兵，先後同聯想、方正、清華同方和TCL，簽訂了操作系統采購協議，在中國獲得了16億美元大單。
微軟利用中國政府的政策，在中國發動了一場“無聲的海灣戰爭”。中國軟件業一直在夾縫中生存，四家大的廠商和微軟進行合作。但是，在中國將近300家硬件廠商，面對國家政策的變化，和中國微利化的電腦市場，Linux的黃金時代終於到來了。
在中國，電腦廠商“預裝正版系統”，必須面對中國多年形成的消費習慣，中國市場購買力也讓他們倍感壓力。2006年下半年，包括DELL、HP、聯想在內，把Linux桌面系統作為降低成本、獲取競爭力的又一個武器。
“軟件正版化運動”，給國內Linux廠商市場突破的機會。與此同時，國內Linux廠商也開始了市場細分，市場重點從政府轉向企業，從通用市場轉向定制市場。中標軟件為海爾定制的40萬套“家家樂應用軟件套件”，按專業群體的專業需求，為農民家庭進行目標定做。
根據用戶需求的定制化，將是Linux的一個發展方向。從目前來看，Linux 桌面系統定制市場，將遠遠大於標准版的市場。微軟利用政治手段，在中國市場推進“正版化”，必然給中國軟件廠商，帶來一次大的市場機會。
從2003年開始，國內Linux廠商就在尋求建立東北亞標准。
科技部“863”在計劃中，資助了Linux相關標准與規范的研究。2003年，由中國電子信息標准研究所牽頭，科技部通過了中文Linux和辦公軟件相關標准與規范、中文Linux應用編程界面規范，中文Linux系統技術要求規范立項。
根據系統規劃拆分為六個項目：Linux標准體系研究、Linux應用編程界面（API）規范、Linux桌面系統技術要求規范、Linux服務器系統技術要求規范、Linux用戶界面規范以及嵌入式Linux技術規范。
2004年4月9日，信息產業部成立了Linux標准工作組。標准組初始成員由“863”計劃，資助項目參與者擴大到13家；隨Linux標准組工作進展，有更多的企業加入Linux標准組，參與企業覆蓋了Linux產業的方方面面。
截止2004年9月30日，Linux標准組正式會員28家，觀察會員2家。被稱為Asianux的亞洲標准，經歷了4年協商和准備，今年4月終於由中國中科紅旗、日本MiracleLinux、韓國Haansoft三家公司共同組建了合資公司。
今年四月份，第四屆東北亞開源軟件推進論壇天津召開。OSS(開放源代碼軟件)論壇，中日韓三國政府官員、開源組織及企業，均組成了龐大的“開源智囊團”。中國推動OSS的發展，從過去集中於Linux到面向整個OSS領域。
隨東北亞開源軟件合作體系形成，Linux標准工作組也為論壇提供更多的標准及相關方向的業務支撐。由於中、日、韓開源產品過於分散，在整個OSS層面合作的同時，共同推動聯合品牌，整合分散的技術資源十分必要。
在“聯合品牌”的市場需求下，年初中科紅旗、日本MiracleLinux及韓國Haansoft共同投資組建的一家新的公司。標准化和通用化需求，為東北亞標准贏得整個產業鏈的支持，提供了必要的條件。
Asianux東北亞標准，為中科紅旗贏得更大的市場機會。中科紅旗和戴爾簽訂的400萬套大單，新發布的中科紅旗Linux5.0，除在技術上更加成熟之外，更加明確的目標市場，也是戴爾鎖定中科紅旗的重要原因。
紅旗5.0在紅旗的各版本中，易用性大大提高了，常用軟件也有所增加，像電騾、bt、office等組件已經集成。安裝大大的簡單化，可以讓一個稍有電腦常識的人自主安裝操作系統了。
特點如下：
強大的Kontact軟件，具備電子郵件、日程管理、地址簿等各種個人信息管理功能；Firefox浏覽器；紅旗軟件最新開發的布谷鳥下載軟件；網絡視頻會議GnomeMeeting；QQ、MSN，Apatite系統；Apatite無線網絡；同時，兼容各種數碼硬件。
Red Hat是世界Linux廠商中，規模最大的一家公司。Red Hat1999年8月份，在納斯達克股市上市，目前市值已達32億美元。2006年12月12日，Red Hat又在紐交所上市，與業界領先的全球性公司站在了一起。
Red Hat進入中國非常晚，然而來的早不如來得巧。2004年11月Red Hat進入中國，兩年時間市場占有率跻身三甲。Red Hat在中國成功，除了上市公司的資金優勢，更重要的在於成功的市場策略。
Red Hat進入中國後，建立起一個政府、教育、企業成功的“三角”。
政府公關層面，提出開放源代碼是軟件產業發展的一種新模式，可以帶來整個軟件產業突飛猛進；用戶教育層面，成為一個很新的學習模式；面對企業，紅帽提供的不僅是一個操作系統，更是基於Linux操作系統上一個整體方案。
有這三個核心概念之後，反映在Red Hat市場架構上，就是市場銷售、工程、服務支持、教育等幾大塊。
在Red Hat的市場策略中，第一是蠶食傳統UNIX的市場，力促UNIX平台向Linux遷移是近幾年的戰略重點。
Linux平台轉移工作量少，只有10%左右的代碼修改量；平台遷移到Linux平台後，技術人員經過5天左右時間，就能在Linux環境下工作；遷移到Linux平台下，總體擁有成本僅占UNIX的50％～70％，性能得到大幅改善，對配套管理軟件的選擇范圍也獲得拓展。
提升渠道伙伴的收益。今年Red Hat將在銷售、技術、培訓、市場營銷等方面給予合作伙伴全方位支持，使渠道伙伴利益和價值實現雙重提升。
Red Hat積極鼓勵產品合作伙伴，發展為紅帽認證培訓合作伙伴，在人力、財力上給予支持。合作伙伴可以將紅帽產品和培訓課程，以全套解決方案的方式銷售，客戶獲得了便利和更高的性價比，合作伙伴也獲得更多的收益。
Red Hat Linux 9.0主要特點：
采用線程（thread）處理NPTL（Native POSIX Thread Library）；Sun Microsystems辦公套裝軟件“StarOffice”，包含文檔、電子表格（SpreadSheet）及演示制作工具；Mozilla浏覽器、郵件客戶端、地址簿、HTML編輯器、及Authoring Tool ；Ximian Evolution電子郵件客戶端軟件，日歷及通迅簿管理軟件、打印功能采用CUPS 、Linux內核采用2.4.20，GCC為3.2.1。WWW服務器支持Apache 2.0 。
Red Hat將在07年2月28日，發布企業級Linux產品Red Hat Enterprise Linux最新產品，新版本最大亮點是虛擬化技術。RHEL 5基於2.6.18版Linux內核，而RHEL 4則基於2.6.9內核。新版本關鍵功能Xen virtualization，能讓一台PC同時運行多個操作系統。
Novell進入中國十幾年之久。2001年中國加入WTO時，國際各大IT公司紛紛進入中國，Novell中國分支機構卻全部撤銷，曾經引起業界一陣嘩然。2002年底，Novell又悄然恢復了中國分支機構。
2003年初，Novell中國區發生人事震蕩，多名高層和技術骨干集體辭職，重新恢復公司在中國用戶中的形象計劃擱淺。隨著Linux的發展，Novell公司在2004年4月，決定把網絡操作系統向Linux轉移，並宣布收購SUSE Linux的計劃。
2004年2月收購SUSE Linux後，Novell擁有基於Linux平台從桌面到服務器全方位解決方案，如今的Novell搖身一變，成了全球第二大Linux分銷商。在 2004年8月份，Novell與共創開源簽署合作備忘錄，嘗試和本土Linux廠商合作打開中國市場。
雖說Novell擅於折騰，2006年Novell最大成就，和微軟結成戰略合作伙伴。根據協議，微軟將對開源軟件提供技術支持，允許Linux 與Windows 兼容，允許Novell的Suse Linux操作系統加入微軟的某些技術。
具體到技術層面，允許Linux在Windows機器上運行，或者允許Windows在Linux機器上運行的虛擬技術，用Linux和Windows混合產品對用戶提供Web服務幫助，文件格式兼容，以便用戶在兩個平台之間共享文件。
微軟對開源軟件從強勢打壓，到和Novell合作顯示出微軟態度的轉變。伴隨Linux的崛起，微軟的戰略已經發生變化。微軟與Zend開源軟件公司，達成了長期合作的協議。早些時候，微軟還發布了一份《微軟開放規范承諾》。
微軟與蘋果僵持數十年後，雙方選擇了合作，Linux將是微軟下一個選擇。而在過去兩年中，微軟逐步建立起了共享源代碼項目，Linux將是微軟下一個合作平台。我們領略了Linux崛起，就連軟件霸主微軟都不敢小視。
這就是微軟在中國發起“軟件正版運動”原因所在。如果微軟拒絕Linux，將意味著微軟將放棄Linux平台的軟件市場。
SUSE Linux 10.0特點：
包含 Firefox最新版本、電子郵件和即時通訊，安全工具如垃圾郵件阻止、防火牆設置等，桌面搜索引擎，OpenOffice.org 2.0 辦公軟件。同時，Novell 還提供工具幫助用戶簡化Windows 系統遷移到 SUSE Linux的過程。
兩年前，袁萌教授曾指責中國Linux廠商，對國際開源社區索取大於回報，甚至有Linux廠商不公開原代碼，這和開源軟件精神是背道而馳的。2006年中國Linux廠商，正以前所未有的熱情投向社區建設。
1月18日，共創開源啟動了Open Desktop社區。6月12日，中科紅旗“Linux人”綜合技術社區上線，中科紅旗、BEA、IBM、Intel、Sybase等公司提供支持。10 月份，拓林思控股股東北京萬裡開源軟件，發起一個完全開放的whitefin開源項目，提供一個以中文為主的開放社區。
中科紅旗年內建設了另外兩個Linux社區，一個是與英特爾合作的UMPC（UMPC，一種便攜式計算機設備）國際社區，另一個將建立OpenAsianux社區。
一直以來，我國Linux廠商與Linux社區發展，都處在一個完全失衡的狀態。國內沒有產生過Fedora、openSUSE這樣具有全球影響力，和大批活躍愛好者的社區，Linux廠商與社區發展處於完全脫節的狀態。
中國沒有建立起自己的Linux社區，因而開發、服務和人才培養，也就不能充分利用社區資源；企業開發Linux在執行GPL規則方面不到位，也沒有培養起我們自己的軟件大師。因此，麒麟操作系統被評為2006另一個“漢芯造假”技術，其內核沒有一行是中國人寫的代碼。
中國開源社區發展緩慢，和缺少資金支持有很大關系。國外很多開源社區，都會有基金會提供項目支持，比如Mozilla基金會對開源項目提供資金保障，而我國政府基金對開源社區支持很少。
中國開源軟件和國外的差距正在拉大。過去中國Linux公司把盈利放在首位，開源社區缺乏廠商資本的支撐，國內開源軟件技術人員缺乏，志願者技術水平與國外有很大差距。中國公司已經意識到，一個好的產品必須有一個好的社區作支撐，而社區發展也需要商業機構的支持。
2006中國“開源社區潮”，和政府支持分不開的。亡羊補牢，為時不晚。
過去Linux有三種贏利模式，第一種是服務器應用方案，目前發展已經比較成熟；第二種是桌面系統，正在推廣之中；第三是嵌入式操作系統，現在規模生產還沒有出來。
在這三種盈利模式中，應用方案是支撐產業發展的現金牛。現金牛做工程，畢竟產奶量不大；開源系統網絡下載，當然不會產生利潤，OEM成為Linux未來之星，像微軟那樣零邊際成本擴張不現實；定制嵌入式操作系統，摩托羅拉自己就有開發團隊，規模超過國內任何一家Linux廠商。
中國Linux市場到現在為止，整個盤子放也不到1億元人民幣，大大小小7家廠商在這裡厮殺，要想獲得成功實在不易。
第四條路，就是增加產品附加值，把人才培訓和產品推廣結合起來，是做大做強的另一個選擇。
紅帽認證證書
2005年4月，REDHAT與神州數碼、上海文華學院和廣東LINUX公共服務技術支持中心，三家中國合作伙伴建立聯盟關系，共同將紅帽認證培訓計劃引入中國市場。去年3月開始，紅帽全球熟練Linux工程師培訓活動，紅帽認證培訓計劃已在北京、上海和廣州連續展開。
紅帽幫助中國企業和培訓機構，更好地選擇使用可靠的軟件技術。作為紅帽教育培訓計劃的一部分，紅帽還與中國著名大學合作，在中國推出紅帽學院計劃(Red Hat Academy)
2006年7月，教育部規劃在首批40所高校中“建立國家Linux技術培訓與推廣中心”項目正式啟動，紅旗作為該項目的唯一系統廠家中標單位，也將協調紅旗產業聯盟的IT技術伙伴，和紅旗軟件教育學院服務體系配合開展相關教育服務工作。
2006年1月，Novell在香港、中國內地和台灣推出一系列SUSE LINUX解決方案，為大中華區企業客戶提供功能強勁、有效及可擴展的開放源代碼產品。Novell還推出了 Linux Certified Linux Engineer（CLE）計劃。
該計劃包括CLE 實習考試和SUSE Certified Linux Professional證書，後者有助於確認SUSE LINUX分發版本的專業知識。在網上，我們可以查到各種Linux，在全國重點城市的培訓課程，廠商培訓、機構培訓和院校培訓，我們可以看到培訓市場已經啟動。
在各種培訓中，我們發現其中最大的問題，是每一個廠家各自為戰，以自己的產品為中心，缺乏Linux核心內容和通用人才的培訓。培訓市場混亂，是當前面臨的最大問題。
10月25日，Oracle首席CEO拉裡·埃裡森在Oracle OpenWorld會議上宣布，將提供完整的Red Hat Linux技術支持。那些由Red Hat提供支持服務的客戶，可以輕而易舉地進行切換，改為由Oracle提供支持。
Oracle對Red Hat溫柔一刀。埃利森的講話讓紅帽市值，立即下跌了10個百分點。甲骨文直接采用紅帽企業版，去除紅帽的商標，兼容源代碼並加入甲骨文的Bug修訂，並采取開源免費發布。甲骨文直接威脅到紅帽的收入，無論從價格還是從服務多元化上，甲骨文的技術支持都強於紅帽。
與Oracle橫刀奪愛相比，微軟則像公子哥兒，直接迎娶了一位遺孀，家財在婚姻協議上獲得了共享。根據微軟和Novell協議，微軟將對開源軟件提供技術支持，允許 Linux與Windows兼容，微軟將允許Novell旗下Suse Linux操作系統加入微軟的某些技術。
微軟與Novell結盟
微軟和Novell的合作，將至少持續到2012年，合作范圍從業務到技術層面均有。技術層面允許Linux在Windows機器上運行，或允許 Windows軟件在Linux 機器上運行虛擬技術，用Linux和Windows混合產品，對用戶提供Web服務幫助，文件格式兼容，以便讓用戶在兩個平台之間共享文件。
這兩件事讓Red Hat倍感尴尬，商業軟件既承認了開源軟件的價值，又要染指開源軟件的市場份額。微軟終於承認Linux是一個真正的、合格的操作系統了，微軟已經無法對它輕視、嘲笑，或吹毛求疵了。微軟正嚴肅地應對Linux帶來的挑戰。
Novell對開源的“背叛行動”，遭到開源愛好者的唾棄。Novell公司希望能夠結束自己Linux 銷售“第二”的身份，希望能取代Red Hat成為該領域中的霸主。Novell這樣做，全世界商業客戶開始對 Novell投注更多的關注。
此前，Kevin Carmony將開源軟件與商用驅動程序、軟件代碼和應用程序混雜在一起，無數自由軟件的發行者們，恨不得把Kevin Carmony釘上十字架。Kevin Carmony促進商業軟件和Linux的融合, 在一些用戶眼中，任何將商業軟件帶進Linux系統的企圖都是罪惡的，這會讓Linux系統疾病纏身。
Linux桌面想要走出自己的小圈子，擁用有一個更為光明、更加廣闊的未來，Freespire 公司的做法無疑是一條正確的道路。開源軟件和商業軟件的結合，至少將兩個不同的世界盡力地統一起來。
2006年Linux系統核心開發者，與自由軟件基金會（FSF）的裂痕不斷擴大。自由軟件基金會不顧眾人反對，一意孤行要推行自己新的GPLv3協議。這是一場發生在“實用主義者”和“理想主義者”之間的沖突。
實用主義者以Linux之父Linus Torvalds為代表，要保持Linux系統核心代碼“純潔”，理想主義者以精神領袖Richard M.Stallman為首，將“反數字版權保護（anti-DRM）”條款，納入下一代GPL協議的自由軟件基金會。
Red Hat公司在今年收購了JBoss，成功地在紐約股票交易所掛牌上市，為繼續鞏固和擴大自己的商業帝國，邁出了更加堅實的一步。從 Novell 到 Red Hat，再到 Linspire，它們動搖和背叛了Linux自由軟件的根基。
也許，在Linux商業化步伐加快之後，將會出現一個Linux商業化陣營，自由軟件運動的理想主義者們，還將在實驗室裡繼續自己的DIY。
困惑將永遠存在。在中國Linux市場上，由於歷史原因到現在有7家Linux公司，在一個不到1億人民幣的市場上爭奪，這本身就是一個非常殘酷的現實。隨Novell和RedHat介入中國市場，市場格局已經發生了變化。
蛋糕本就不大，還要怎麼分？
2005年Novell的32.9%市場份額、30%出貨量，領跑中國Linux服務器市場，Novell與RedHat的進入，在市場上打破了國產開源軟件的格局。Linux廠商之間人才爭奪，以及市場容量不足，國內7家廠商的出路，成為生存最大的困惑。
硬件廠商大規模預裝Linux，主要是為了降低銷售成本，消費者是否真的應用還是一個問題。消費者購買電腦時安裝的是Linux，買回家之後直接格式化，這種Linux的正版化只是規避法律的一個權宜之計。
微軟的Vista和Office2007，絕大部分源代碼被改寫，微軟對Linux構成兼容壁壘。Linux成熟度沒有微軟快，研發上追加投入將成為巨大的難題。用戶需求多元化，硬件驅動、多媒體、游戲軟件，在產業鏈上還無法實現完美的融合。
Linux桌面版本各不相同，各自的支持者都無法占有市場主流。Linux未來在桌面系統方面取得突破，除非Linux桌面版本能夠統一內核，或某行版變得更加受到歡迎。版本的競爭使廠商淘汰步入叢林法則
微軟跟Novell達成協議，向Novell購買Linux專利權，引起開源人士的普遍反對。Novell向微軟支付一定費用，換取使用Linux不被微軟的侵犯起訴。微軟繞開GNU GPL許可協議要求，而更新GPL許可協議，修正當前GPL版本授權范圍，也將成為GPL面臨的法律問題。