2006年，微軟與Linux廠商之間的糾紛白熱化，當時微軟與Novell達成了一個標志性的協議。在此之前，微軟與多家Linux廠商出現了專利權糾紛，其中包括軟件公司TurboLinux和Xandros，以及硬件廠商京瓷美達和富士施樂。
今年4月，微軟宣布已經與HTC達成協議。HTC每售出一部Android手機都需要向微軟支付一定的專利使用費。微軟總法律顧問布拉德·史密斯(Brad Smith)表示，與HTC之間的協議向行業傳達了信號，即微軟正認真應對Android系統的興起。他表示：“通過與HTC達成協議，我們實際上宣布，我們對於提供授權持開放態度。”
過去一周中，微軟又宣布與多家小型Android設備廠商達成協議。這些廠商包括Onkyo、Wistron、Velocity Micro和General Dynamics Itronix等。
不過，微軟應對Android的方式與應對Linux的方式仍有所不同。在與Linux廠商的糾紛中，微軟避免采取法律手段。在向Linux廠商提供專利授權很久之後，微軟與Linux廠商之間才出現了第一起訴訟。當時，微軟起訴了GPS設備商TomTom，但這起訴訟很快達成和解。
目前，微軟開始在較早的階段就訴諸法律。在宣布與HTC達成協議之後不久，微軟就對摩托羅拉提起訴訟。最近，微軟還起訴了邦諾書店，稱該公司采用Android系統的Nook閱讀器侵犯了微軟的知識產權。
此外，在應對Linux時，微軟是唯一一家尋求損失賠償的公司。然而目前，在手機市場，有關專利權的糾紛非常復雜，諾基亞和蘋果也在起訴其他一些廠商。蘋果和諾基亞於今年早些時候解決了雙方之間的專利權糾紛，但蘋果仍在繼續起訴HTC。而諾基亞也在尋求通過專利授權獲得營收。此外，甲骨文已經就Android系統直接對谷歌提起訴訟。
由於意識到專利的重要性，微軟已經聯合其他多家公司，包括蘋果、RIM和索尼共同收購了北電網絡破產拍賣中的約6000項專利，收購價格為45億美元。這將避免這些專利落到谷歌等競爭對手的手中。
此次與Android廠商之間的專利權大戰對微軟來說可能更加重要。在桌面市場，Windows系統的銷量遠好於Linux系統，因此微軟的Windows銷售收入遠高於專利授權收入。然而在移動操作系統領域，微軟的專利授權收入有可能高於Windows Phone 7的銷售收入。
有分析師估計，微軟通過HTC售出的每部Android手機獲得5美元的收入，而微軟正尋求向其他Android廠商收取每部手機兩位數的授權費。近期韓國媒體報道稱，微軟希望向三星收取每部Android手機15美元的費用。不過，如果三星能夠拿出有關Windows Phone手機的發展路線圖，那麼微軟可以降低專利授權收費標准。
微軟拒絕對與HTC之間的專利授權協議置評，也拒絕透露與其他公司進行專利授權談判的情況。不過可以肯定，微軟的律師已經接觸了幾乎所有Android設備廠商。