由於紅帽等Linux 廠商尚未與微軟達成類似的協議，因此，由於用戶害怕被卷入與微軟這位法庭訴訟老手的糾紛之中，他們可能紛紛會選擇拋棄紅帽，轉而使用Novell的產品。
盡管Linux 是免費的，但系統提供商們還為用戶提供軟件套裝，文檔，安裝及維護服務，因此，用戶從紅帽遷移意味著他們要重新花錢。
哥倫比亞大學法學院的教授，紐約軟件自由法律中心的創始人Eban Moglen 說：“要麼用戶棄紅帽而去，要麼紅帽與微軟達成協議。”
作為自由軟件倡導人之一的Moglen說，微軟的協議繞過了Linux 等自由軟件使用的“通用公共許可證”(GNU General Public License)。
為此，Moglen等人正在完善通用公共許可證，以便自由軟件用戶免受微軟等公司的起訴。
Novell和微軟的協議規定，兩家公司不會因為專利侵權而起訴對方的用戶，為此，微軟同意支付給Novell 3.48億美元，而Novell將支付給微軟4000萬美元，Novell的金額要少些，主要原因是它的客戶數量要比微軟的少。
微軟表示，Linux 當中的一些技術存在著它的專利，盡管微軟從來就沒有說清楚究竟是什麼技術。
微軟首席執行官史蒂夫·鮑爾默已經表示，如果用戶從除Novell以外的任何廠商那裡購買Linux ，他們都將面臨麻煩。
鮑爾默最近對eWeek.com 網站的記者說：“如果你使用的是非SUSE版本的Linux ，那麼就你侵犯了我們的專利。”SUSE Linux是由Novell開發的操作系統。
鮑爾默說：“我覺得，用戶可能會以為這個問題是軟件銷售商的事情，但這是錯覺。如果你下載非SUSE版本的Linux ，請你三思而後行。”
微軟生產Windows 操作系統，每年，微軟依靠這種操作系統獲取了數十億美元的使用費用，但Linux 已經成為微軟的心腹大患，因為它是免費的。
Linux 主要由志願者創建，維護和改進，這些人按照通用公共許可證協議進行軟件的復制，修改及改進。